公卫助理医师《生物化学》蛋白质的化学知识

时间:2021-04-22 17:02:40 公卫执业助理医师 我要投稿

2017年公卫助理医师《生物化学》蛋白质的化学知识

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2017年公卫助理医师《生物化学》蛋白质的化学知识

  第一节 蛋白质的分子组成

  一、蛋白质的元素组成

  主要有 C、H、O、N、S。

  各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%。

  二、蛋白质的基本组成单位——氨基酸

  蛋白质在酸、碱或蛋白酶的作用下,最终水解为游离氨基酸(amino acid),即蛋白质组成单体或构件分子。存在于自然界中的氨基酸有300余种,但合成蛋白质的氨基酸仅20种(称编码氨基酸)。

  (一)氨基酸的结构通式

  组成蛋白质的20种氨基酸有共同的结构特点:

  1.氨基连接在α- C上,属于α-氨基酸(脯氨酸为α-亚氨基酸)。

  2.R是側链,除甘氨酸外都含手性C,有D-型和L-型两种立体异构体。天然蛋白质中的氨基酸都是L-型。

  (二)氨基酸的分类

  1.按R基的化学结构分为脂肪族、芳香族、杂环、杂环亚氨基酸四类。

  2.按R基的极性和在中性溶液的解离状态分为非极性氨基酸、极性不带电荷、极性带负电荷或带正电荷的四类。

  带有非极性R(烃基、甲硫基、吲哚环等,共9种):甘(Gly)、丙(Ala)、缬(Val)、亮(Leu)、异亮(Ile)、苯丙(Phe)、甲硫(Met)、脯(Pro)、色(Trp)

  带有不可解离的极性R(羟基、巯基、酰胺基等,共6种):丝(Ser)、苏(Thr)、天胺(Asn)、谷胺(Gln)、酪(Tyr)、半(Cys)

  带有可解离的极性R基(共5种):天(Asp)、谷(Glu)、赖(Lys)、精(Arg)、组(His),前两个为酸性氨基酸,后三个是碱性氨基酸。

  (三)氨基酸的重要理化性质

  1.一般物理性质

  α-氨基酸为无色晶体,熔点一般在200 oC以上。各种氨基酸在水中的溶解度差别很大(酪氨酸不溶于水)。一般溶解于稀酸或稀碱,但不能溶解于有机溶剂,通常酒精能把氨基酸从其溶液中沉淀析出。

  芳香族氨基酸(Tyr、Trp、Phe)有共轭双键,在近紫外区有光吸收能力,Tyr、Trp的吸收峰在280nm,Phe在265 nm。由于大多数蛋白质含Tyr、Trp残基,所以测定蛋白质溶液280nm的光吸收值,是分析溶液中蛋白质含量的快速简便的方法。

  2.两性解离和等电点(isoelectric point, pI)

  氨基酸在水溶液或晶体状态时以两性离子的形式存在,既可作为酸,又可作为碱起作用,是两性电解质,其解离度与溶液的pH有关。

  在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势和程度相等,成为兼性离子,呈电中性,

  此时溶液的pH称为该氨基酸的等电点。

  3.氨基酸的化学反应

  氨基酸的化学反应是其基团的特征性反应。

  (1)茚三酮反应

  所有具有自由α-氨基的氨基酸与过量茚三酮共热形成蓝紫色化合物。

  (2)与2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应

  三、肽(peptide)

  1.肽键与肽链

  一个氨基酸的`α-羧基和另一个氨基酸的α-氨基脱水形成的酰胺键称为肽键。多肽链的方向性是从N末端指向C末端。

  肽分子中不完整的氨基酸称为氨基酸残基。肽按其序列从N端到C端命名。一般10肽以下属寡肽,10肽以上为多肽。

  2.生物活性肽

  谷胱甘肽(glutathione,GSH)

  是由Glu、Cys、Gly组成的一种三肽,又叫γ-谷氨酰半胱氨酰甘氨酸(含γ-肽键)。

  第二节 蛋白质的分子结构

  一、蛋白质的一级结构(primary structure)

  蛋白质一级结构是空间结构和特异生物学功能的基础。

  二、蛋白质的二级结构(secondary structure)

  蛋白质的二级结构是指其分子中主链原子的局部空间排列,是主链构象(不包括侧链R基团)。

  两种主链原子的局部空间排列的分子模型(α-螺旋)和(β-折叠)。

  1.肽单位

  肽键及其两端的α-C共6个原子处于同一平面上,组成了肽单位(所在的平面称肽键平面)。

  肽键C—N键长为0.132nm,比相邻的单键(0.147nm)短,而较C=N双键(0.128nm)长,有部分双键的性质,不能自由旋转。肽键平面上各原子呈顺反异构关系,肽键平面上的O、H以及2个α-碳原子为反式构型(transconfiguration)。

  2.α-螺旋

  α-螺旋是肽键平面通过α-碳原子的相对旋转形成的一种紧密螺旋盘绕,是有周期的一种主链构象。其特点是:

  ② 螺旋每转一圈上升3.6个氨基酸残基,螺距约0.54nm

  ②相邻的螺圈之间形成链内氢键,氢键的取向几乎与中心轴平行。

  ③螺旋的走向绝大部分是右手螺旋,残基侧链伸向外侧。R基团的大小、荷电状态及形状均对α-螺旋的形成及稳定有影响。

  3.β-折叠

  ① 相邻肽键平面间折叠成110度角,呈锯齿状。

  ② 两个以上具β-折叠的肽链或同一肽链内不同肽段相互平行排列,形成β-折叠片层,其稳定因素是肽链间的氢键。

  ③ 逆向平行的片层结构比顺向平行的稳定。

  α-螺旋和β-折叠是蛋白质二级结构的主要形式。

  4.β-转角

  5.不规卷曲

  6.超二级结构和结构域

  三、蛋白质的三级结构(tertiary structure)

  指一条多肽链中所有原子的整体排布,包括主链和侧链。维系三级结构的作用力主要是次级键(疏水相互作用、静电力、氢键等)。在序列中相隔较远的氨基酸疏水侧链相互靠近,结合蛋白质的辅基往往镶嵌其内,形成功能活性部位,而亲水基团则在外,这也是球状蛋白质易溶于水的原因。

  四、蛋白质的四级结构 (quaternary structure)

  有些蛋白质的分子量很大,由2条或2条以上具有独立三级结构的多肽链通过非共价键相互结合而成,称为蛋白质的四级结构。构成四级结构的每条多肽链称为亚基 (subunit),亚基单独存在时一般没有生物学功能,构成四级结构的几个亚基可以相同或不同。如血红蛋白(hemoglobin,Hb) 是由两个α-亚基和两个β-亚基形成的四聚体。

  五、蛋白质分子中的化学键

  蛋白质的一级结构是由共价键形成的,如肽键和二硫键。而维持空间构象稳定的是非共价的次级键。如氢键、盐键、疏水键、范德华引力等。

  第三节 蛋白质结构与功能的关系

  一、蛋白质一级结构与功能的关系

  (一)一级结构是空间构象的基础

  如果一级结构未破坏,保持了氨基酸的排列顺序就可能回复到原来的三级结构,功能依然存在。

  (二)种属差异

  (三)分子病

  镰刀状红细胞贫血病。

  二、蛋白质空间结构与功能的关系

  蛋白质的空间结构是其生物活性的基础,空间结构变化,其功能也随之改变。

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  第四节 蛋白质的理化性质

  蛋白质的理化性质和氨基酸相似,有两性解离及等电点、紫外吸收和呈色反应。还有胶体性质、沉淀、变性和凝固等特点。

  一、蛋白质的高分子性质

  蛋白质的水溶液具有亲水胶体的性质。颗粒表面的水化膜和电荷是其稳定的因素,调节pH至pI、加入脱水剂等,蛋白质即可从溶液中沉淀出来。

  透析法是利用蛋白质不能透过半透膜的性质,去掉小分子物质,达到纯化的目的。

  大小不同的蛋白质分子可以通过凝胶过滤分开。又称分子筛层析。

  二、蛋白质的两性解离

  蛋白质和氨基酸一样是两性电解质,在溶液中的荷电状态受pH值影响。当蛋白质溶液处于某一pH时,蛋白质解离成正、负离子的趋势相等,即成为兼性离子,净电荷为零,此时溶液的pH称为该蛋白质的等电点。pH>pI时,该蛋白质颗粒带负电荷,反之则带正电荷。在人体体液中多数蛋白质的等电点接近pH5,所以在生理pH7.4环境下,多数蛋白质解离成阴离子。少量蛋白质,如鱼精蛋白、组蛋白的pI偏于碱性,称碱性蛋白质,而胃蛋白酶和丝蛋白为酸性蛋白。

  三、蛋白质的变性、沉淀和凝固

  蛋白质在某些理化因素的作用下,空间结构被破坏,导致理化性质改变,生物学活性丧失,称为蛋白质的变性(denaturation)。

  蛋白质变性的本质是多肽链从卷曲到伸展的过程,不涉及一级结构的改变。变性作用不过于剧烈,是一种可逆反应,去除变性因素,有些蛋白质原有的构象和功能可恢复或部分恢复,称为复性(denaturation)。

  蛋白质变性的主要表现是失去生物学活性,变性蛋白溶解度降低,易形成沉淀析出;易被蛋白水解酶消化。

  蛋白质自溶液中析出的现象,称为蛋白质的沉淀。盐析、有机溶剂、重金属盐、生物碱试剂都可沉淀蛋白质。盐析沉淀蛋白质不变性,是分离制备蛋白质的常用方法。如血浆中的清蛋白在饱和的硫酸铵溶液中可沉淀,而球蛋白则在半饱和硫酸铵溶液中发生沉淀。乙醇、丙酮均为脱水剂,可破坏水化膜,降低水的介电常数,使蛋白质的解离程度降低,表面电荷减少,从而使蛋白质沉淀析出。低温时,用丙酮沉淀蛋白质,可保留原有的生物学活性。但用乙醇,时间较长则会导致变性。重金属盐(Hg2+、Cu2+、Ag+),生物碱与蛋白质结合成盐而沉淀,是不可逆的。

  凝固是蛋白质变性发展的不可逆的结果。沉淀的蛋白质不一定变性(如盐析)。

  四、蛋白质的紫外吸收和呈色反应

  蛋白质含芳香族氨基酸,在280nm波长处有特征性吸收峰。

  例题:

  1.测得某一蛋白质样品的氮含量为0.40g,此样品约含蛋白质多少?

  A.2.00g  B.2.50g  C.6.40g  D.3.00g   E.6.25g

  2.下列含有两个羧基的氨基酸是:

  A.精氨酸 B.赖氨酸 C.甘氨酸  D.色氨酸  E.谷氨酸

  3.维持蛋白质二级结构的主要化学键是:

  A.盐键  B.疏水键  C.肽键   D.氢键    E.二硫键

  参考答案

  1.B 2.E 3.D

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