自国际金融危机爆发以来，各国出口下滑，国内失业率增加，贸易竞争不断加剧，贸易保护主义重新强化的趋势也日益明显。据世界银行统计，自金融危机爆发以来，20国集团中有17个国家一共推出约78项贸易保护主义措施，其中47项已经付诸实施。为促进本国经济尽早复苏，一些国家还会继续采取各种贸易限制措施和保护措施来促进出口和保护国内产业发展，贸易保护势力还将在很长一段时间内不断抬头，并成为国际贸易和世界经济复苏的威胁。
贸易依存度较高的东盟国家和中国都是贸易保护主义的受害国之一，尤其是中国，自金融危机以来，遭遇的反补贴、反倾销立案明显增多。2008年全球35％的反倾销案件、70％的反补贴案件是针对中国出口产品的。2009年前三季度共有19个国家和地区对中国产品发起88起贸易救济调查，总金额约为102亿美元。以美国对中国输美轮胎、油井管等产品采取贸易限制措施，欧盟对产自中国的无缝钢管和铝箔征收为期五年的正式反倾销税为例，不仅给中国企业造成了严重影响，也给处于上下游产业链的东盟国家带来了损失。中国和东盟国家在应对金融危机以来的一年多里，坚持贸易自由化，共同抵制贸易保护，取得了很大的成绩。未来，中国与东盟还将继续站在同一立场，反对发达国家发起的贸易保护措施，并以实际行动表明推进贸易自由化的决心。
(三)区域经济合作成为亚洲各国的现实选择
由于历史和政治等多方面因素的影响，亚洲区域经济合作在很长的一段时间都处于停滞不前的阶段。但进入21世纪以来，亚洲地区的区域经济合作有了新的发展。当前，区域经济合作已经成为区内各国的现实选择。东盟分别和中、日、韩、印度签订了FTA，韩国和新加坡、东盟整体以及印度签订了FTA，日本和东盟整体及东盟中的七国签订了经济伙伴协定(EPA)，中国和中国香港、澳门地区、东盟整体、巴基斯坦和新加坡签署了FTA，在亚洲地区已经形成了交错分布的FTA网络。未来，各国还会继续推进区域经济合作，亚洲地区的区域经济合作环境正向积极的方向发展，FTA网络将会更加发达和完善，地区的经济一体化水平将会进一步提升，这将为中国与东盟的自贸区建设提供更加积极而良好的区域合作外部环境。
但另一方面，这也给中国与东盟自贸区的建设带来了新的挑战。首先，东盟与日、韩、印度及澳新FTA的签订，使得各国在东盟市场上的竞争更加激烈，中国因与东盟签订FTA所拥有的优势正在不断削弱。其次，各国争先与东盟推进FTA，令东盟有了更多的谈判资本。未来，中国扩大对东盟的自贸区建设将面临着日、韩、印度、澳新乃至美欧的竞争压力。
(四)东盟经济持续好转和一体化进程的稳步推进