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自动化系设有自动化本科专业，是控制理论与控制工程二级学科依托的实体单位，目前拥有控制理论与控制工程硕士学位授予权，我校自动化专业创办于1979年，在近30年发展道路中，自动化专业为包装行业和湖南省培养了近3000名投身经济建设主战场、为地方经济社会发展服务的专业人才。2005年被评为湖南省重点专业，2008年被评为湖南省特色专业，同年被确立为国家级特色专业建设点。
自动化教学团队汇聚了一批教学科研人才，已形成了一个强有力的教学团队，全系教师15人，其中硕士生导师3人，教授4人，副教授3人、讲师6人，具有博士学位4人、硕士学位8人、在职攻博6人，湖南省“121”人才工程第二层次人选1人，教育部本科教学指导委员会委员2人，并在教学研究、人才培养、专业与课程建设和科研等方面取得了一系列的突出成果。获国家教学成果二等奖1项，省级教学成果一等奖3项，二等奖1项，三等奖3项;包装自动化方向教学团队被省教学厅立项为省级教学团队。《单片机应用技术》为国家精品课程，《自动控制原理》为湖南省精品课程，《EDA技术及应用》入选国家“十一五”规划教材，自动化系入选首批湖南省普通高等学校优秀教研室。
自动化系科研实力雄厚，科研方向覆盖面宽，涉及到智能控制理论与应用、复杂生产过程建模与优化控制、智能检测与自动化装置、图像处理与模式识别、智能机器人系统与技术、生物医学信息处理等广泛领域。近5年来，自动化系承接各类科研项目近40项，共获得国家科技进步二等奖3项，省部级科技进步奖一等奖2项、二等奖2项、三等奖3项，在国内外学术刊物和会议上发表论文100余篇，，培养硕士生15人。