机电学院设有两办(院办和总支办)、五个系(机械工程系、汽车工程系、电气信息工程系、农业工程系和物理与电子科学系)、三个研究所(农业工程、机械工程及其自动化和汽车工程研究所)，以及汽车驾驶员培训部。
目前全院教职工100人，其中教授11人，副教授24人，国家有突出贡献专家1人，获得博士学位8 人。本院下设机械设计制造及其自动化、农业机械化及其自动化、电气工程及自动化、车辆工程、电子科学与技术五个本科专业和汽车运用与维修、电子信息技术、数据库管理、WEB应用程序设计四个专科高职专业。现有在院研究生和普通本专笠学生1400多人，机械设计制造、农村机电函授和自考学生200多人。
福建农林大学机电工程学院热忱欢迎高层次人才到我院工作，热忱欢迎优秀高毕业生报考我院有关专业，热忱欢迎用人单位到我院聘用毕业生。