扬州大学医学院坐落在历史悠久、人文荟萃、风景秀丽的历史文化名城扬州城区，办学历史悠久、办学特色鲜明。医学院的前身可追溯到创立于1950年的苏北卫生学校。1958年升格为扬州医学专科学校，1984年经原国家教委批准升格为本科院校，更名为扬州医学院。1992年与在扬其他5所高校合并组建扬州大学。医学院是全国首批设置妇产科学专业、率先招收中西医结合专业、护理学本科专业的医学院校，也是迄今在全国唯一开设临床医学皮肤性病防治专业方向的医学院校。医学院是卫生部性病防治基地，教育部全国职教师资培训基地(护理学)、司法部监狱管理局罪犯心理咨询培训基地、司法部戒毒局戒毒矫治培训基地，也是江苏省社区矫正心理咨询培训基地、江苏省养老护理培训基地，是本地区医药人才培养、医疗服务和医学科学研究中心。
医学院设有基础医学与医学技术系、临床医学系、中西医结合学系、药学系和护理学系。拥有省级基础医学实验教学示范中心、中央与地方共建临床医学教学实验中心和药学综合教学实验室。现设有临床医学、中西医结合临床医学、护理学、药学、医学检验技术等5个本科专业，学制5年或4年。临床医学专业开设妇产、皮肤病性病防治、麻醉与重症医学等辅修方向，护理学专业开设助产护理辅修方向，中西医结合临床医学专业开设针灸推拿辅修方向。医学院也是经教育部批准的可招收来华留学生医学本科教育(英语授课)的学校。根据最新统计，我院毕业生参加全国临床执业医师资格考试，首次考试通过率(80.94%)高于全国平均通过率(62.84)18.1个百分点;护士执业资格考试通过率100%。本科学生毕业一次性学位授予率连续3年在99%以上，学生考研录取率占应届毕业生的42.5%，标志着我院医学本科教育质量不断向高水平、高层次迈进。
在学科建设方面，医学院现拥有博士学位授权一级学科(中西医结合)1个，博士后流动站1个。拥有基础医学、临床医学、中西医结合、公共卫生与预防医学、药学、中药学、护理学等7个硕士学位授权一级学科以及临床医学、中药学等2个专业硕士学位授权点，覆盖内、外、妇、儿、护理、药学、预防等56个二级学科硕士点，是国家第一批临床医学硕士专业学位研究生培养模式改革试点高校。拥有江苏省一级学科重点学科1个，省级重点实验室1个，省级临床重点专科18个，中央财政支持地方高校发展专项资金建设项目1个。基础医学、临床医学、中药学为校级一级学科重点学科。拥有省级精品课程(含成人教育)3门，校级精品课程(含成人教育)12门。拥有江苏省特聘教授、“双创计划”、“333高层次人才工程”、“六大人才高峰”、“青蓝工程”、“博士集聚计划”等省级以上高层次医学科技人才。拥有江苏省苏北人民医院、扬州市第一人民医院、扬州市中医院等9所临床医学院，还有遍布省内外30余所教学实习医院、2个药业集团、1个药品检验所为实践教学基地。现有在读全日制本科生2050人，全日制博士(后)、硕士研究生392人，6年制临床医学专业来华留学生(MBBS)项目284人，从而形成了从本科生、研究生到博士后，从全日制到留学生教育的全方位、多层次的高等医学教育体系。
医学院高度重视科研工作，近年来承担国家自然科学基金项目、国家科技支撑计划项目等国家级课题100余项，取得了一大批高水平的科研成果，产生了显著的社会效益和经济效益。学院设有《实用临床医药杂志》编辑部，该杂志为全国公开发行的核心学术期刊，2004年获全国科技期刊评比一等奖，连续五届获教育部“中国高校优秀期刊奖”。学院现为中国高校科技期刊研究会医学期刊专业委员会第二届常务委员会主任委员单位。
医学院办学60多年来，始终以培养合格医药人才为已任，立足苏中、服务江苏、辐射全国，以“求是、求实、求新、求精”的校风和“坚苦自立”的校训砥砺奋进，乘势而上，打造出“基础好、实践强、吃得苦、用得上、干得好”的扬医毕业生品牌，赢得了社会各界的广泛赞誉。校友遍及海内外，涌现出全国优秀共产党员、全国劳动模范、“白求恩奖章”获得者吴登云等一大批杰出校友，为祖国医药卫生事业和社会进步作出了积极的贡献。