近年来，电子科技大学大力加强学科建设，取得了丰硕的成果。
2002年，电子科技大学物理电子学、电路与系统、微电子学与固体电子学、电磁场与微波技术、通信与信息系统和信号与信息处理6个二级学科被批准为国家重点学科，成为全国唯一在电子科学与技术、信息与通信工程两个一级学科中所有二级学科均为国家重点学科的高校。2007年电子科学与技术和信息与通信工程两个一级学科被批准为一级学科国家重点学科，光学工程和计算机应用技术两个学科被批准为国家重点（培育）学科。
在2002年和2006年的两次全国高校一级学科评估中，电子科技大学电子科学与技术一级学科的排名从第3名上升到第2名；信息与通信工程 一级学科由第8名上升到第5名。
2008年，电子科技大学马克思主义理论、数学、物理学、机械工程、光学工程、仪器科学与技术、材料科学与工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、生物医学工程、管理科学与工程、工商管理12个一级学科被批准为一级学科四川省重点学科，数量经济学、应用化学、行政管理3个二级学科被批准为二级学科四川省重点学科。