一、国家级重点学科
1、一级学科国家重点学科
(1)海洋科学：涵盖物理海洋学、海洋化学、海洋生物学、海洋地质4个二级学科。
(2)水产学：涵盖水产养殖、渔业资源、捕捞学3个二级学科。
2、二级学科国家重点学科：环境科学，水产品加工及贮藏工程。
3、国家重点培育学科：港口、海岸及近海工程。
二、山东省重点学科
水生生物学、药物化学、船舶与海洋工程、环境工程、会计学、气象学、地图学与地理信息系统、海洋物理学(海洋信息探测与处理)、计算机应用技术、应用化学、地球探测与信息技术、遗传学、计算数学、区域经济学、外国语言学及应用语言学、中国现当代文学、环境与资源保护法学、社会学、金融学、防灾减灾工程及防护工程。