在综合大学中，提到日语，就不能不提南开大学。作为综合性重点大学南开，日语专业的办学水平是全国一流的。在日本语能力测试的辅导用书中，我们看到最多的都是南开大学出版社的书籍，他们所编纂的辅导用书质量高，重点突出。”南开大学日本语言文学系拥有教师15人，其中教授3人，副教授10人。其研究生培养方向主要分为：日本语学方向、日本文学方向、何日本文化方向。具体来说，日本语学主要涉及日语词汇学、日中语言文化比较研究等领域;日本文学主要研究日本古典文学、日中文学比较等;日本文化方面主要进行日本文化研究、日中文化比较研究等领域的探讨。
南开大学还另设有日本研究院。本院属于国家重点学科，博士学位授予单位。是对日本进行综合性研究的实体学术机构。现有教授7人，且均为博士生导师，副教授10人。主要研究方向为：日本政治史(博士学位授予权)、日本经济史(博士学位授予权)、日本近代外交史(中日关系史，博士学位授予权)、日本社会史(家族制度史，博士学位授予权)、日本文化史(洋学史)、日本经济(硕士、博士授予权)、日本政治。
招生方向： 南开大学日本研究院：世界史日本史方向、国际政治日本政治方向、世界经济日本经济方向;
外国语学院：日本语学、日本文学、日本文化专业。