建设工程学院成立于2001年5月，是由原长春科技大学的工程技术学院和环境与建设工程学院的部分专业合并而成的。学院现有勘查技术与工程、土木工程2个本科专业。有地质工程、岩土工程、防灾减灾及防护工程、结构工程、桥梁与隧道工程5 个硕士点和地质工程、建筑与土木工程2个工程硕士点。设有地质工程、地质灾害防治工程2个博士点和地质资源与地质工程博士后流动站。学院下设勘察工程系、工程地质及防灾减灾工程系、岩土工程系、道桥基础工程系、建筑工程系、隧道与地下工程系和6个研究所。
学院现有教职工99人，博士生导师11人，教授19人，副教授19人。其中，俄罗斯自然科学院外籍院士1名，国家“百千万人才工程”人选2名，教育部跨世纪优秀人才1名，国土资源部“百名”跨世纪科技人才2名，吉林省有突出贡献中青年专家1名，吉林省科技人才2名，吉林省杰出青年1名，吉林省省管优秀专家 3名，享受国务院政府特贴6名。国内外知名的钻探专家张祖培、殷琨、孙友宏教授，岩土工程专家肖树芳、佴磊、陈剑平、王清教授在我院任教。
学院现有“国土资源部复杂条件钻进技术开放研究实验室”，“教育部地球信息探测仪器重点实验室”“国土资源部地球探测技术及仪器重点实验室”“地热资源开发教育部工程研究中心”。
我院科研项目多且成果突出。现承担国家级、省部级科研项目50余项，在研项目资金达一千多万元。近年来获国家级、省部级科技成果一、二、三等奖10余项，部分科研成果达到国内领先水平，尤其在地质工程领域，已达国际先进水平。我院正瞄准社会发展前沿课题，大力进行科技攻关，在岩土钻掘工程方面，针对人类上天、入地、下海、登极的伟大计划，积极开展月球钻探、科学深钻、极地冰钻、海洋钻探等方面的研究;在土木工程方面，积极开展岩土工程、道桥工程、建筑工程、隧道工程、地下工程、地质灾害防治工程等方面的研究，为工程建设和改善人类的生存环境贡献力量。
学院现有本科生880余人，硕士研究生200余人，博士研究生100 余人，每年还招收相当数量的成人教育函授生。浓郁向上的学术氛围，求实创新的教育理念，培养了一大批具有理论素养和实践能力的博士、硕士研究生。每年的本科毕业生，有17%被推荐为免试研究生，30%考取了研究生，部分同学考取了清华、复旦、同济、上海交大等著名院校的研究生。每届毕业生，有40%分配到京、津、沪和重庆四大直辖市，其余都到省会及大中城市就业。
学院与国际上有着广泛的科技合作和学术交流，与俄罗斯、美国、英国、乌克兰、日本、韩国、澳大利亚、加拿大、法国、德国、奥地利等10几个国家和地区的 20余所大学和研究所在科学研究、学术交流和人才培养等方面建立了长期密切的合作关系。我院教授先后几十人次出国进行学术交流和科研合作。我院发明的液动射流式冲击器，受到德国科学钻井委员会和美国史密斯跨国公司的高度评价，并建立了科研合作关系。系列工程探测仪已形成三大系列产品，远销日本、俄罗斯、香港等国家和地区。
学院正依托吉林大学多学科综合优势，形成以地质工程学科为龙头，带动岩土工程、桥梁与隧道工程、结构工程等多学科协同发展的学科群。其研究领域涉及地质、能源、矿业、交通、市政、建筑等国家基础产业;研究范围包括“地下-地面-地上”三维一体的工程勘察、设计、施工和监理等。学院的建设目标是在本领域成为国内外有较高影响的高级人才培养的摇篮和科技成果的研发中心。