随着高等教育改革的不断深入，东北财经大学研究生教育也取得了令人世瞩目的成就，自1981年取得硕士学位授予权以来的二十年间为国家输送了大批博士、硕士等高级经济管理人才，他们现已成为国民经济各部门的骨干和中坚。
1986年东北财经大学获得博士学位授予权，至今已经有二个一级学科博士学位授予权，14个博士学位授权点，23个硕士学位授权点。博士、硕士学位专业跨理论经济学、应用经济学、工商管理学、法学、文学等五大学科。
1993年东北财经大学获得工商管理硕士（MBA）学位授予权，成为全国第一批经国务院学位办批准的，有权授予工商管理硕士（MBA）学位的26个试点单位之一。在2000年国务学位办对MBA试点单位的评估过中，我校MBA教育紧随清华大学名列全国第2位。
学校为研究生教育配备了高档次的教学与生活设施，如研究生专用的教学楼、专用机房等。
东北财经大学研究生教学与管理以提高教育质量为目的，采取了一系列切实可行的、科学的制度和措施，取得了良好的效果。在1996年辽宁省学位办组织开展的研究生教学管理检查评估中，我校获得了辽宁省研究生教学管理优秀单位称号；1998年获辽宁省招生先进单位称号；2003年，在教育部组织的全国高等学校招生工作评优中，我校研究生招生办公室工作出色、成绩突出，被评为“全国高校招生工作先进集体”。